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Bien que plusieurs protocoles *peuvent* être utilisés, le protocole le plus courant pour transférer des fichiers entre les systèmes Unix et Linux est le Secure Copy Protocol (SCP). , un protocole basé sur Secure Shell (SSH). D'autres options incluent SFTP (SSH File Transfer Protocol) qui est également basé sur SSH et offre plus de fonctionnalités, et des options moins sécurisées comme FTP (File Transfer Protocol) et rcp (copie à distance). Cependant, SCP et SFTP sont préférés pour leur sécurité.
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