PDB signifie Banque de données sur les protéines. Il s'agit d'un référentiel de données structurelles tridimensionnelles de grosses molécules d'importance biologique, telles que les protéines, l'ADN et l'ARN. Le PDB est une archive maintenue par la Worldwide Protein Data Bank (wwPDB), un consortium du Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB), de l'Institut européen de bioinformatique (EMBL-EBI) et de la Protein Data Bank Japan (PDBj). Le PDB contient des structures de biomolécules déterminées expérimentalement, notamment des coordonnées atomiques, des conditions expérimentales et d'autres données pertinentes. Les données de la PDB sont librement accessibles au public et sont utilisées par les scientifiques à des fins de recherche, d'éducation et de conception de médicaments.
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