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MS-DOS n'a pas de "logiciel" comme le pourrait une application moderne. Le shell MS-DOS *est* le logiciel. C'est l'interpréteur de ligne de commande. C'est ce qui gère la saisie des commandes (comme `DIR`, `COPY`, `FORMAT`) et les exécute. Il n'y avait pas de programme séparé *exécutant* le shell ; le shell *était* l'interface utilisateur principale du système d'exploitation. Les fichiers principaux responsables de cela sont « COMMAND.COM » (dans les versions antérieures) ou « IO.SYS » et « MSDOS.SYS » (fonctionnant ensemble dans les versions ultérieures). Ces fichiers ne sont pas des applications en soi, mais ils constituent le logiciel fondamental qui constitue la fonctionnalité du shell MS-DOS.
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