MicroATX n'augmente pas le coût total d'un système en fonction du nombre de slots d'extension sur la carte mère. Les cartes mères MicroATX ont généralement moins de connecteurs d'extension que les cartes mères ATX, ce qui peut entraîner une baisse du coût de la carte mère elle-même. Cependant, la différence de coût est généralement négligeable et n’affecte pas de manière significative le coût global du système. Le coût total d'un système dépend de divers facteurs, tels que les composants choisis (par exemple, CPU, GPU, mémoire, stockage), la taille du boîtier, l'alimentation électrique et les fonctionnalités ou accessoires supplémentaires.
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