Sur un disque nouvellement formaté, les fichiers ne sont initialement stockés dans aucun bloc. Le disque est vide et ne contient qu'une structure de système de fichiers (comme NTFS, FAT32, ext4, etc.). Cette structure définit la manière dont l'espace disque sera organisé en blocs, mais les blocs eux-mêmes sont vides jusqu'à ce que des fichiers y soient écrits.
Une fois qu'un fichier est écrit, le système de fichiers du système d'exploitation alloue une série de *blocs de données* contigus ou non contigus pour contenir les données du fichier. Ces blocs ont généralement une taille fixe (par exemple 4 Ko, 8 Ko, etc.) définie par le système de fichiers. En plus des blocs de données, d'autres blocs peuvent être utilisés pour des éléments tels que les métadonnées du fichier (nom, taille, horodatage, etc.) qui sont généralement conservées dans des blocs *inode* (dans les systèmes de type Unix) ou des structures similaires.
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