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Il n'est pas possible de brancher une carte PCI-e dans un emplacement PCI. Les connecteurs des deux normes sont différents et aucun adaptateur n'est disponible pour convertir entre eux.
Les emplacements et cartes PCI-e ont plus de broches et des connecteurs plus gros que les emplacements et cartes PCI. Le PCI-e est également électriquement différent du PCI :les périphériques PCI fonctionnent à 3,3 V tandis que les périphériques PCI-e peuvent fonctionner à 3,3 V ou 12 V. Ils ne sont pas électriquement compatibles et tenter d'utiliser l'un dans l'autre peut gravement endommager le matériel.
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